Если в МоемСкладе Вы используете минимальную цену для товара, можно настроить контроль цены при сохранении сделки.
Для контроля минимальной цены в сделке Битрикс24 включите опцию контрол минимальной цены в разделе "Настройка фильтров".
При установке в сделке цены на товар ниже минимальной, сделка не будет сохранятся и будет выходить предупреждение.
Если в настройках приложения Вы используете выгрузку заказа поставщику из МоегоСклада в Битрикс24, контроль минимальной цены не будет работать для указанного в настройках приложения направления сделок.