На закладке "Модификации" настраиваются свойства модификаций Битрикс24, в которые будут синхронизироваться остатки товаров из МоегоСклада.
Для удобства можно создать дополнительное свойство типа "дата/время" для сохранения момента актуализации остатка в Битрикс24.
Вы можете настроить синхронизацию только для определенных складов. Не обязательно создавать в Битрикс24 поля для каждого склада.
Дополнительные поля для модификаций в Битрикс24 создаются непосредственно через карточку модификации. Можно использовать любую модификацию.