Для обновления списка элементов откройте закладку "Справочники" в настройках приложения.
Нажмите кнопку "Справочники"
Откроется окно с списком доступных справочников. Нажмите кнопку с названием нужного справочника.
С помощью иконок обновления/добавления можно обновить название элемента в Битрикс24 или добавить новый элемент.
Если элемент справочника был удален в МоемСкладе, можно удалить соответствующий элемент в Битрикс24 с использованием иконки